在永乐七年四月，舟山军的第二旅精锐——邓荣部和李进义部，从已占领並加固多月的宜兰寨出发，在鸡笼山当地原住民的指引下，悄悄沿山林小道穿行，计划绕过鸡笼山，奇袭基隆寨要塞，而另一支舟山军主力水师则向北直逼基隆岛机枪阵地，以期形成两麵包夹的態势。
    宜兰寨经过半年建设，已成为舟山军稳定的后方基地，邓荣部和李进义部士气高昂、装备精良，尤其是经过多次战斗歷练的陆战队士兵更显老练。两部人马在黎明前悄然出发，每人携带足够的乾粮、短兵器与少量火銃，儘量减少负重以便於穿行山林。
    鸡笼山的林间小道在原住民的带领下异常顺利地穿行，白昼里，山林中迴荡著鸣蝉和飞鸟声，掩盖了士兵行进的动静。邓荣与李进义两位指挥官时刻关注著地形变化，谨慎推进，避免与基隆寨的巡逻队碰面。傍晚时分，舟山军在基隆寨附近的山林隱蔽驻扎，准备夜间行动。
    与此同时，舟山军主力水师一路北上，接近基隆岛外围水域，目標直指岛上的机枪阵地。舟山军早已获悉陈宇在岛上布置了三部马克沁机枪，这些火力恐怖的武器曾多次击退来袭敌军，舟山军对此极为忌惮。
    为此，舟山军主战船採取“试探式进攻”，派出轻型战船不断在岛上机枪阵地射程边缘游弋，时而缓慢前进，时而快速撤退，尝试吸引机枪开火。他们的目的是耗尽对方的弹药、让机枪阵地过热失灵。一艘艘轻快的舟山船只在岛外围游走，不断逼近、撤退，製造出一种逼迫感。
    基隆岛上的守军果然被激怒，郑广下令机枪开火，密集的子弹扫向靠近的舟山军船只，但舟山军灵活的战术让基隆岛上的火力无法精准打击，反而让机枪连续开火造成了过热。隨著时间推移，机枪阵地的火力频率开始下降，有的机枪甚至发出了卡弹声。
    入夜后，基隆寨的守军正忙於支援岛上，寨內兵力已有所分散。邓荣与李进义判断时机成熟，率领部队从山林中悄悄逼近寨墙，手持短弓弩、轻便火銃，步步逼近。山林间的夜色为他们提供了极佳的掩护，加上鸡笼山地形复杂，基隆寨的瞭望哨並未察觉到有敌人逼近。
    在距离寨墙不过数百米的灌木丛中，邓荣低声下令：“弓弩准备，隨时待命。弩手先击杀哨兵，隨后火銃组前压。”伴隨命令，数名弩手悄无声息地搭箭上弦，对准了基隆寨墙上的守哨士兵。几声轻微的弦响过后，哨兵应声倒地。
    守军的反应稍有迟疑，这一瞬间，李进义部的火銃手立即挺进，向寨门发起猛烈的火力压制。基隆寨內一阵骚动，但被调往基隆岛的守军来不及返回支援，寨內的兵力並不足以有效防守。趁著守军慌乱之际，邓荣率部迅速突破寨墙，成功突入基隆寨外围防线。
    在基隆岛的围攻战线上，舟山水师主力抓住机枪阵地火力停滯的空隙，果断向基隆岛发起突袭，炮手们瞄准岛上薄弱的防御环节齐发齐射，震耳欲聋的炮声在夜空中轰鸣。负责守岛的郑广试图组织反击，但由於机枪阵地的火力不足，基隆岛的守军一时无法有效还击。
    舟山军的船只趁势逼近岛屿外围，成功抢占了部分水上据点。岛上的守军士气受到打击，逐渐处於守势。基隆岛的战况急转直下。
    舟山军在经歷了第一轮突袭成功后，迅速开始对基隆寨展开全面攻势。邓荣部和李进义部作为陆战队的精锐，已经渗透到基隆寨外围，並开始与守寨的郑庆部和叶谅部展开激烈的巷战。同时，基隆寨的守军通过无线电对讲机向澎湖的陈宇告急，请求迅速增援以稳固防线。
    在进入寨內后，邓荣和李进义的部队迅速遭遇郑庆和叶谅的抵抗。郑庆部早已在寨內布设路障、箭塔、火油等防御措施，试图以地形优势削弱舟山军的攻势。叶谅部作为从高雄调来的精锐，此时已严阵以待，与郑庆部紧密协同，將舟山军引入窄巷后猛烈反击，利用熟悉的地形实施灵活的打击，逐步將战斗推向胶著状態。
    面对顽强的抵抗，邓荣与李进义果断下令投入弓弩与火銃，集中火力对付寨內的防御工事，逐步压缩郑庆部的防守空间。儘管舟山军攻势猛烈，但基隆寨的守军凭藉地利和对讲机的协调指挥，將各小队兵力灵活调动，使得舟山军一时难以全面突破。
    与此同时，基隆寨內守军的无线电对讲机紧急连线澎湖的陈宇，將基隆寨当前激烈战况和危急形势详细匯报。听闻基隆寨已被舟山军重兵围攻，陈宇意识到战局形势严峻，立即命令澎湖各部预备兵力，隨时准备支援基隆。同时，陈宇下令，优先稳固澎湖要地防线，以防舟山军的进一步入侵。由於局势紧急，陈宇只得加派林元仲的巡逻队在基隆周边海域警戒，企图在水上截击舟山军的后援部队。
    基隆寨告急的同时，舟山军的主力水师已经突破基隆岛外围的数重防线，进入岛屿附近水域展开强力围攻。在接连的激战中，舟山军付出了一定的代价，几艘年久失修的楼船和龟甲船在炮火中严重受损，部分沉没，但整体攻势却越发猛烈。
    郑广部的机枪阵地一度给舟山军造成了不小的威胁，但在弹药逐渐耗尽后，郑广意识到岛屿已岌岌可危，若继续顽抗，一旦被敌人突破阵地，守军手中的马克沁机枪將极有可能被舟山军缴获。为避免这一先进火器落入敌手，郑广忍痛作出决定，命令士兵將机枪周边的火药桶点燃，在一声震耳欲聋的爆炸声中，机枪阵地被炸得四分五裂，郑广本人也壮烈自尽。
    机枪阵地爆炸后，基隆岛的防御力量明显削弱，舟山军水师趁势而上，逐步压缩岛上守军的空间。岛上守军士气动摇，而郑广的自尽则进一步影响了防御士气。至此，舟山军已基本控制住基隆岛外围，向岛中心稳步推进。
    与此同时，邓荣部和李进义部在寨內经过激烈的巷战，已逐步控制住基隆寨的外围，郑庆部和叶谅部的防线逐步被压缩到核心区域。守军对讲机不断传出各处失守的消息，士兵们的战意逐渐动摇，尤其在岛上守军毁掉机枪阵地自尽的消息传回基隆寨后，不少守军意识到孤立无援，开始出现撤退之势。
    基隆战役的第三阶段，舟山军已成功攻陷基隆岛的机枪阵地，而寨內守军也逐渐面临全面失守的局面。郑庆眼见火药桶的爆炸和机枪阵地的毁灭，顿时心如死灰，明白他的兄弟郑广已经壮烈殉主。眼下基隆寨周围的防线已被舟山军彻底压制，他一咬牙，决意与舟山军死战到底。
    愤怒与悲痛之下，郑庆提剑冲向舟山军的先锋李进义，决心为兄弟报仇。两人激战三十合，郑庆拼尽全力，但终因技不如人，逐渐落入下风。在一轮激烈的交锋中，李进义抓住破绽，挥舞长矛突刺而出，一击命中郑庆胸口，郑庆当即力尽倒地，含恨而终。
    临终前，郑庆对隨从们下达了最后的命令，將基隆寨的失守消息通过无线电传回澎湖，留下了他的遗言：“死亦不辱我基隆寨，將士当自知义，不负大义。”
    在郑庆战死后，叶谅作为守寨的另一指挥官，眼看郑庆已亡，形势已无法挽回。此时，正迎面遇上舟山军的邓荣部。邓荣身形壮硕高鼻深目光头纹身，手持六十斤重的回鶻大铁棍，威势惊人，儼然一个金刚战將。叶谅瞬间识破对方是舟山军的精锐大將，权衡之下自知无法取胜，且此刻舟山军主力已从北面的滩头登陆，正在基隆寨外围形成合围之势。
    意识到无力回天，叶谅果断做出突围决定，迅速率领范家军残余兵力向南面突破。范家军在叶谅的指挥下强行突围，拼死击退了部分舟山军，最终带著残兵败將从基隆寨撤出，沿海岸线一路南逃，退回高雄以待时机。
    与此同时，陈宇在澎湖得知基隆危急，立刻派遣海盗林元仲部前往增援。林元仲率领舰队迅速北上，途中在新竹海域遭遇舟山军海军第一旅的阮恩和赵达部队。双方在新竹外海展开激烈海战，双方舰船在海面上追逐、对射，交战中火炮轰鸣，水面激起无数水花，战况十分激烈。
    就在海战进入胶著状態时，林元仲的对讲机里突然传来基隆寨失守的消息，並伴隨著郑庆的遗言。林元仲听闻基隆已破，守军全军覆没，决心不再纠缠，当即下令撤退，带领残余舰队转向澎湖方向，避免在基隆战役中投入更多兵力。
    在主將郑庆战死、叶谅突围后，基隆寨已失去了有效的防御指挥，留守的少数守军在舟山军的持续进攻下最终崩溃。邓荣、李进义率部清剿残余守军，迅速占领基隆寨內各要地，彻底控制了基隆寨。此时，基隆战役宣告结束，舟山军取得了基隆的全面胜利。
    此役之后，舟山军在基隆一线的控制权得到稳固，为进一步深入台澎地区、发起对陈宇领地的进一步攻势奠定了战略基础。同时，郑氏兄弟的殉主消息传回澎湖后，也极大动摇了陈宇手下的士气。澎湖的陈宇意识到舟山军实力强大，防线岌岌可危，必须更加谨慎地筹谋接下来的防御部署，以应对舟山军的步步紧逼。